第一波攻击结束后，除了负责侦察的飞机和在空中执行护航任务的战斗机外，俯冲轰炸机和平行轰炸机都按照计划返回航母进行弹药加挂，准备迎接下一轮更为猛烈的攻击。而此时，港口外面倭国的战列舰和巡洋舰并没有停止攻击的脚步，它们继续向港口内那些还没有沉没的舰艇连续发射炮弹，试图将米军在珍珠港的海军力量彻底摧毁，为倭国的战略目标奠定坚实基础。
在珍珠港的战场上，局势紧张到了极点。众人目光聚焦之处，只见米军仍有四艘巡洋舰在顽强抵抗，它们与港口外的倭国战列舰和巡洋舰展开了激烈对射。炮口火光闪烁，硝烟弥漫，巨大的轰鸣声震耳欲聋，仿佛是钢铁巨兽在怒吼咆哮。米军巡洋舰上的水兵们，眼神中透着坚定与决绝，他们深知此刻的处境艰难，但绝不轻言放弃。在对射的同时，他们还在迅速移动舰艇，试图冲破港口的封锁，与鬼子的战列舰进行正面的对轰较量。这一勇敢的举动无疑吸引了倭国潜艇的注意，四艘潜艇瞅准时机，分别向这四艘巡洋舰发射了五枚鱼雷。鱼雷在海水中如幽灵般急速穿梭，带着致命的威胁直逼目标。
在一阵接一阵令人胆寒的连续爆炸声中，四艘巡洋舰在发射出最后一轮炮弹的不甘声中，缓缓沉没入港口的深水之中。那巨大的舰体逐渐被海水淹没，只留下一串串气泡和水兵们绝望的呼喊声在海面上回荡。但四艘潜艇的好运似乎也到此为止了。只见不顾一切冲过来的米国十艘鱼雷艇，如愤怒的狼群一般，向着浮在水面的六艘倭国潜艇射出了复仇的鱼雷。此时，来不及潜入水下的倭国潜艇，只能依靠每艇上面的四挺 20mm 高射机枪，向着鱼雷来袭的方向疯狂射击，试图阻挡这致命的攻击。而两艘还没有发射鱼雷的潜艇，在这千钧一发之际，顾不得快速飞来的鱼雷艇，毅然将五枚鱼雷射向正在一边不断射击，一边缓慢向出口行驶的两艘米国驱逐舰。
潜艇上的倭国水兵们，此时已将生死置之度外，他们拼命地向鱼雷艇射击，两艘前部备有 120mm 炮的潜艇分别击中了五艘近在咫尺的鱼雷艇，但愤怒的鱼雷也毫不留情地将三艘躲避不及的潜艇瞬间撕碎，让它们付出了极为高昂的代价。其他鱼雷艇在发射完一波鱼雷后，由于来不及装填新的鱼雷，竟毅然决然地向着浮在水面上的三艘潜艇直接撞去。刹那间，三艘鱼雷艇以惊人的速度拦腰将潜艇直接撞翻转过去，同时在潜艇身上撞出一个大口子，汹涌的海水如脱缰的野马般直接从潜艇中部灌进去。而三艘几百吨的鱼雷艇也在从潜艇身上冲过去后，因巨大的冲击力失去平衡，直接翻倒在水里。剩下的两艘鱼雷艇一边以灵活的蛇形线路躲避港口外战列舰的猛烈炮击，一边争分夺秒地装填鱼雷，但终究还是没能躲过那如雨点般密集的炮弹，最终被无情地打沉，消失在波涛汹涌的海面上。
港口内的驱逐舰和小型舰船，在巡洋舰和战列舰与倭国战列舰和巡洋舰激烈对攻的宝贵时机，迅速启动了发动机，并且缓缓向港口外移动。然而，它们的行动面临着巨大的阻碍，许多舰艇仅仅移动了几十米，便在与倭国战列舰和巡洋舰的惨烈战斗中被击沉。那些二千多吨的驱逐舰，根本经受不住三发三百多毫米炮弹的猛烈轰炸，瞬间陷入绝境。好在有鱼雷艇快速机动的英勇冲锋，为它们提高航速赢得了宝贵的时间。十几艘驱逐舰齐心协力，一同向港口外的战列舰和巡洋舰发起猛烈对轰，它们的炮弹如雨点般倾泻而出，虽然驱逐舰的炮弹口径相对较小，但其发射速度极快，在十几艘快速移动的驱逐舰、护卫舰和倭国的战列舰对轰过程中，又巧妙地掩护了十几艘鱼雷艇不要命地冲锋。
驶出港口的四艘鱼雷艇，此时已将生死置之度外，它们连瞄准都顾不上，对着港口外面三海里远那宽大的战列舰各放出六枚鱼雷。而就在放出鱼雷的瞬间，它们也被炮弹击中。毕竟，这几百吨的小艇，根本无法承受二百多毫米炮弹爆炸所产生的强大冲击波。十几艘鱼雷艇以自杀式的进攻方式，给四艘战列舰以重创，其中有两艘战列舰开始慢慢向下沉没。但凶狠顽强的倭国水兵，即便面临着战舰即将沉没的绝境，也没有选择弃舰逃生，而是在缓慢的沉没过程中，依然与港口里的驱逐舰展开激烈对轰，直至战舰最终完全沉没，他们的战斗精神令人既敬佩又胆寒。
十几艘驱逐舰在激烈的战斗中逐渐减少，当剩下最后八艘时，它们已经接近港口出口。由于驱逐舰的炮弹口径较小，只有靠近敌舰才能发挥出最大效能，因此它们不顾被倭国巡洋舰的猛烈炮击，毅然向两艘战列舰的吃水线附近拼命发射着破甲弹。在密集的攻击下，战列舰的几十个部位被炸开大口子，海水如潮水般一齐灌入，两艘战列舰的舰体逐渐倾斜，慢慢沉入水中。但八艘驱逐舰也为此付出了惨重代价，最后只有两艘还在做着最后的挣扎，它们顽强地向三艘倭国巡洋舰发射破甲弹。然而，在十几分钟后，这两艘驱逐舰终究还是承受不住几十发二百多毫米炮弹的连续袭击，缓缓沉入水底，只留下一片漂浮的残骸和无尽的硝烟。
经过长达五六个小时的惨烈战斗，珍珠港的港口水面上到处漂浮着水兵的尸体和战舰的残骸，一片狼藉惨不忍睹。港口里的水面上已经没有任何一艘完整的战舰，曾经那繁忙而强大的太平洋舰队基地，此刻已化为一片废墟。而倭国剩下的三艘巡洋舰，却并未停止攻击的脚步，它们一发一发地将炮弹精准地打向港口内的船坞。船坞内那些正在修理或新建的军舰，在炮弹的无情轰炸下被撕成碎片，船坞的设施也被严重破坏，海水汹涌灌入，将这里彻底摧毁。